器質性陽痿主要是針對病因進行治療；器質性陽痿的病因非常多，首先應明確引起陽痿的原因。如果是糖尿病引起的陽痿應針對糖尿病進行治療；如果是藥物引起的陽痿應停用或者是調整藥物治療；對於血管性陽痿可應用血管外科手術治療；對某些器官性陽痿不能解決其病因者，可以使用陰莖假體植入手術、化學假體療法、血管重建手術、陰莖負壓療法等等。這些方法都是可以有效的治療器質性陽痿，具體的方法具體使用。
以下兩種手術對治療器質性陽痿有不錯的效果：
1、動脈血管重建術
動脈血管重建術治療陽痿是一種常見的器質性陽痿手術，血管重建術治療勃起功能障礙目的，是在堵塞或狹窄的髂腹下動脈-陰莖海綿體動脈床建立動脈旁路，提高陰莖海綿體內動脈灌流壓和血流量，以達到治療勃起功能障礙。
2、顯微外科動脈搭橋術
在性生活中，陰莖的勃起，需要大量的血液從陰莖背動脈灌注海綿體，如果陰莖背或陰莖海綿體動脈發生動脈粥樣硬化，可使血管腔狹窄或栓塞，或者是出現動脈漏，就會導致動脈供血不足，從而導致陰莖無法勃起，發生陽痿。
