造成性功能障礙的原因大致可以分成三類：生物因素、精神心理因素和文化因素。
1、生物因素。性功能障礙可能由遺傳、健康狀況、激素水平、年齡、疾病（包括慢性病、神經精神系統疾患、內分泌疾病、生殖器官病變）等多種原因所引起。藥物、長期大量酗酒或吸毒者，也會出現性功能障礙。
2、精神心理因。素精神心理因素對性功能的影響比較突出，包括錯誤的性觀念、過去性經歷的影響、環境因素、人際關系緊張和各種外界因素所造成的負面情緒等。
3、文化因素。受宗教和文化背景的影響，某些人對性生活存在偏見（如認為一滴精十滴血），認為性交會損耗元氣，主觀上放棄或減少性活動，容易造成性壓抑。
女性性功能障礙常見問題
1、性慾抑制。是指女性長期沒有性慾，但在男方要求性生活時仍會同意，表現為一開始就對性行為不感興趣，或表現為對性生活接受能力低，有很多因素可以促成對性缺乏欲望，包括激素的變化，醫療條件和待遇變化，比如癌症和化療，抑鬱症，懷孕，壓力與過度疲勞，對有規則的性愛方式感到苦惱與厭倦，也可能促成對性缺乏熱情。
2、性厭惡。是對性生活一貫有病態的憎惡反應，對任何形式的性接觸，如接吻，擁抱，都抱有否定的態度，有時一想到性生活就會感到憂慮，厭惡，甚至產生出汗，惡心，緊張，嘔吐和腹痛的症狀，盡量躲避性刺激。
3、性喚起障礙。是性慾產生緩慢，沖動遲發，但如喚起後仍可有正常的性表現。
4、性慾高潮。功能障礙分為原發性和繼發性兩種。 原發性性慾高潮功能障礙指女性有性興奮，但從未出現過性高潮。 繼發性性慾高潮功能障礙指既往有過性慾高潮，但現在消失。
5、性交疼痛。包括外陰，陰道及下腹部的疼痛，疼痛時間可分為性交進行中與性交結束後，性交疼痛可由一系列問題引起，包括子宮內膜異位症，骨盆腔腫瘤，卵巢囊腫，陰道炎，陰道不夠潤滑，外在的一些疤痕組織或性傳播疾病。
6、陰道痙攣。指環繞陰道口和陰道外1/3部位的肌肉非自主性痙攣或縮窄，在性交時因陰道痙攣，疼痛而使陰莖不能進入陰道。 陰道痙攣可分為原發性與繼發性兩種，原發性陰道痙攣為性器官一旦接觸，陰道即痙攣，無法完成性生活。 繼發性陰道痙攣則為以往有正常性生活，數月或數年後突然出現痙攣的情況，根據痙攣產生的時間，可以分為性交前，性交進行中兩種，前者不能完成性生活，後者可使性交中斷，甚至配偶極感疼痛。
7、神經性焦慮與性恐怖症。是指對將要進行的性生活產生恐怖與懼怕心理，平時若一接觸此問題，就會產生或發作神經性的不安與焦慮。
女性性功能障礙涉及生理、病理、心理、社會等因素，一般需要心理治療和激素藥物等治療。
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