直腸指診是診斷攝護腺肥大症的重要檢查手段，幾乎每個以排尿困難為主要症狀的男性就診患者，都應做直腸指診。臨床上描述攝護腺肥大症時腺體大小的常用方法如下。
正常攝護腺：正常攝護腺如栗子大小，平坦，邊緣清楚，質韌，均勻有彈性，無結節或壓痛，中央溝稍凹陷，兩側葉對稱，推移略活動。
Ⅰ度肥大症：肥大症的攝護腺較正常增大1.5～2倍，中央溝變淺，突入直腸距離約為1～2cm，攝護腺增大似雞蛋大小。
Ⅱ度肥大症：攝護腺較正常增大2～3倍，中央溝消失或略突出，突入直腸距離超過2～3cm，攝護腺增大似鴨蛋大小。
Ⅲ度肥大症：增大的攝護腺腺體腫大嚴重，突入直腸超過3cm，中央溝明顯突出，檢查時手指不能觸及腺體上緣，攝護腺增大似鵝蛋大小。
但要注意，直腸指診估計的攝護腺大小不夠準確，如中葉肥大症，腺體突入膀胱，直腸指診時攝護腺增大不明顯，指診攝護腺大小正常不能排除攝護腺肥大症。直腸指診時如發現攝護腺硬度增大，表面凹凸不平，有可疑硬結，應作細胞學檢查等，以排除攝護腺癌。
